Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H3Q13889 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms