Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOFQ13790 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOFQ13790 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOFQ13790 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOFQ13790 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOFQ13790 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOFQ13790 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOFQ13790 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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