Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNA1SQ13698 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1SQ13698 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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