Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CUL4BQ13620 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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