Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CUL4AQ13619 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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CUL4AQ13619 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4AQ13619 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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