Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL1Q13616 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CUL1Q13616 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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