Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEUROD1Q13562 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
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