Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB3Q13509 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms