Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE3BQ13370 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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