Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLAMF1Q13291 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLAMF1Q13291 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms