Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPA4Q13156 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPA4Q13156 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms