Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CALCOCO2Q13137 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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