Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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TRAF1Q13077 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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TRAF1Q13077 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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TRAF1Q13077 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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TRAF1Q13077 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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TRAF1Q13077 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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TRAF1Q13077 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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TRAF1Q13077 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF1Q13077 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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