Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM2Q13029 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
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