Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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