Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF4Q08170 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF4Q08170 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF4Q08170 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF4Q08170 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF4Q08170 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF4Q08170 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF4Q08170 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF4Q08170 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF4Q08170 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF4Q08170 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF4Q08170 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SRSF4Q08170 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SRSF4Q08170 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF4Q08170 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms