Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCN1BQ07699 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms