Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms