Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms