Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms