Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms