Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms