Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MC1RQ01726 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms