Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN7AQ01118 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN7AQ01118 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms