Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms