Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HERVK_113P63121 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms