Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113P62684 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms