Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LMO4P61968 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LMO4P61968 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LMO4P61968 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LMO4P61968 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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