Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJA9P57773 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA9P57773 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA9P57773 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA9P57773 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA9P57773 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA9P57773 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA9P57773 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA9P57773 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GJA9P57773 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJA9P57773 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJA9P57773 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJA9P57773 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms