Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MTCP1P56278 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms