Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GFRA1P56159 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms