Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23AP54725 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms