Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCL1P53675 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCL1P53675 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCL1P53675 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCL1P53675 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCL1P53675 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCL1P53675 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCL1P53675 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLTCL1P53675 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCL1P53675 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCL1P53675 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLTCL1P53675 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTCL1P53675 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms