Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC25A1P53007 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC25A1P53007 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms