Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
THOP1P52888 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
THOP1P52888 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
THOP1P52888 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
THOP1P52888 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
THOP1P52888 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
THOP1P52888 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms