Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms