Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRPC1P48995 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms