Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NESP48681 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NESP48681 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NESP48681 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NESP48681 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NESP48681 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NESP48681 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NESP48681 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NESP48681 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NESP48681 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NESP48681 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NESP48681 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
NESP48681 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
NESP48681 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NESP48681 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NESP48681 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NESP48681 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NESP48681 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NESP48681 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NESP48681 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NESP48681 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NESP48681 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NESP48681 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NESP48681 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NESP48681 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NESP48681 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NESP48681 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NESP48681 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NESP48681 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NESP48681 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms