Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms