Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ME1P48163 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ME1P48163 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ME1P48163 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ME1P48163 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ME1P48163 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ME1P48163 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ME1P48163 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ME1P48163 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ME1P48163 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ME1P48163 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ME1P48163 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ME1P48163 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ME1P48163 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ME1P48163 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ME1P48163 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ME1P48163 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ME1P48163 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ME1P48163 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ME1P48163 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ME1P48163 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ME1P48163 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ME1P48163 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms