Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC6A9P48067 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms