Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACADSBP45954 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms