Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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