Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPOP42166 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPOP42166 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPOP42166 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPOP42166 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPOP42166 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPOP42166 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPOP42166 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPOP42166 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPOP42166 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPOP42166 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPOP42166 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPOP42166 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPOP42166 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPOP42166 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPOP42166 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPOP42166 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPOP42166 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPOP42166 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPOP42166 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPOP42166 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPOP42166 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms