Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL15A1P39059 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms