Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAEP38570 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms