Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBRP36941 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LTBRP36941 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LTBRP36941 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LTBRP36941 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LTBRP36941 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms