Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTN2P35609 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms