Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGS2P35354 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms