Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASP1P29466 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASP1P29466 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CASP1P29466 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASP1P29466 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms